Nature子刊:中外學(xué)者發(fā)現(xiàn)溶酶體相關(guān)疾病關(guān)鍵蛋白調(diào)控機(jī)制
日期:2017-02-07 09:37:49
2017年1月23日由中科院昆明動(dòng)物所離子通道藥物研發(fā)中心、美國(guó)哥倫比亞大學(xué)和清華大學(xué)合作完成的最新研究成果Structural basis of Ca2+/pH dual regulation of the endolysosomal Ca2+ channel TRPML1在《自然》(Nature)雜志子刊Nature Structural & Molecular Biology上在線發(fā)表。研究人員綜合運(yùn)用X射線晶體學(xué)、生物化學(xué)、冷凍電子顯微鏡和電生理等技術(shù)手段,解析了IV型粘脂質(zhì)貯積癥(MLIV)關(guān)鍵蛋白TRPML1的重要結(jié)構(gòu)域的高分辨率三維結(jié)構(gòu),揭示了生理?xiàng)l件下的理化因素(鈣離子和酸性pH)對(duì)TRPML1的調(diào)控機(jī)制以及TRPML1功能失調(diào)和MLIV相關(guān)基因突變的直接相關(guān)性。
溶酶體是一種細(xì)胞器,即細(xì)胞內(nèi)的一種超微結(jié)構(gòu),為單層包被的囊泡,可降解細(xì)胞內(nèi)的各種生物大分子,并為新的生物大分子提供原料,是細(xì)胞的處理與回收系統(tǒng)。溶酶體功能缺陷直接導(dǎo)致生物大分子不能正常降解而在溶酶體中貯積,其結(jié)果是溶酶體隨之發(fā)生腫脹,細(xì)胞也變得臃腫失常,細(xì)胞功能受到嚴(yán)重影響,最終導(dǎo)致疾病,稱為溶酶體貯積癥。MLIV為溶酶體貯積癥的一種,其癥狀表現(xiàn)為智力發(fā)育遲緩、眼功能異常(如視網(wǎng)膜變性,角膜混濁)、鐵和胃酸缺乏。患有MLIV的兒童在一歲時(shí)常表現(xiàn)出認(rèn)知、語(yǔ)言和運(yùn)動(dòng)障礙。研究發(fā)現(xiàn)瞬時(shí)受體電位通道成員TRPML1是MLIV的遺傳致病決定性因素,多達(dá)20余種TRPML1基因突變可導(dǎo)致MLIV。TRPML1主要定位在后期內(nèi)涵體和溶酶體,該通道具有一些非常重要的特征:如受 pH 和Ca2+ (溶酶體內(nèi)pH值約為4.5,含 0.5 mM Ca2+)調(diào)節(jié),通透Ca2+ 和 Fe2+(溶酶體含高濃度的此類二價(jià)離子)等。然而,這些特征的分子和生物物理機(jī)制,這些機(jī)制是否對(duì)TRPML1在溶酶體中的生理功能起至關(guān)重要的作用,以及溶酶體貯積癥相關(guān)基因突變所造成的TRPML1功能失調(diào)的分子機(jī)制目前尚不清楚。 生物通 www.ebiotrade.com
針對(duì)上述問(wèn)題,中科院昆明動(dòng)物所離子通道藥物研發(fā)中心、美國(guó)哥倫比亞大學(xué)和清華大學(xué)合作對(duì)TRPML1通道進(jìn)行了深入的結(jié)構(gòu)功能研究。為了了解鈣離子和酸性pH對(duì)TRPML1調(diào)控的機(jī)制,研究人員重點(diǎn)研究了該通道第I、II跨膜片段(TM1 和TM2)之間的一個(gè)長(zhǎng)連接片段I-II linker,此結(jié)構(gòu)域內(nèi)的3種氨基酸點(diǎn)突變均會(huì)導(dǎo)致MLIV。他們獲得了I-II linker在三種不同pH值下的晶體結(jié)構(gòu),這三種pH對(duì)應(yīng)于溶酶體、后期內(nèi)涵體和細(xì)胞表面膜的pH值。結(jié)構(gòu)顯示I-II linker為旋轉(zhuǎn)對(duì)稱的四聚體,四聚體中央形成一個(gè)直徑為14 Å的腔孔(luminal pore),通過(guò)由16個(gè)氨基酸殘基組成的腔孔環(huán)連接。鈣離子和質(zhì)子作用于此腔孔,從而雙重調(diào)控TRPML1通道活性,符合溶酶體內(nèi)的低pH值和高濃度鈣離子的理化特征。隨后他們使用冷凍電鏡對(duì)這一結(jié)構(gòu)進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證,獲得全長(zhǎng)TRPML1的胞外域分辨率為5.28Å的結(jié)構(gòu)。此胞外域絕大部分由I-II linker組成,是一個(gè)四聚體,且中心有一個(gè)很大的孔,這一結(jié)構(gòu)與I-II linker的晶體結(jié)構(gòu)高度吻合,表明I-II linker的片段晶體結(jié)構(gòu)的正確性。此外,MLIV致病突變會(huì)改變這一結(jié)構(gòu)域的結(jié)構(gòu)并且導(dǎo)致TRPML1通道蛋白的細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸發(fā)生錯(cuò)誤。這一研究首次為了解TRPML1這一重要蛋白的調(diào)控,組裝,功能以及MLIV致病的分子機(jī)理提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),具有重要的科學(xué)意義,也為MLIV的治療提供了新思路。




