藥物耐受是腫瘤治療領(lǐng)域的一大難題，一般分為兩種類型：其一為原發(fā)性耐藥，即先前未經(jīng)治療的腫瘤細(xì)胞天生就對某種藥物不敏感；其二是獲得性耐藥，指經(jīng)過治療的腫瘤細(xì)胞再次接受該藥物治療時(shí)變得不敏感。目前，國際上許多科研小組都在研究腫瘤耐藥性的機(jī)制，希望以此為臨床上腫瘤治療的個(gè)體化用藥提供依據(jù)，提高腫瘤治療的效率。

近日，中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室與生物芯片上海國家工程研究中心合作， 利用高通量的基因芯片技術(shù)， 研究了胃癌細(xì)胞株對羥基喜樹堿（hydroxycamptothecin，HCPT）原發(fā)性耐藥的分子機(jī)制，相關(guān)成果發(fā)表在2011 年2 月份的《中國藥理學(xué)報(bào)》（Acta Pharmacologica Sinica，APS）上。

作者首先選取了6 種不同品系的人類胃癌細(xì)胞，用SRB（Sulforhodamine B）法檢測這些胃癌細(xì)胞對HCPT 的耐受能力。結(jié)果發(fā)現(xiàn)耐受力由低到高依次為：AGS < NCI‐N87 < HGC‐27 < MGC‐803 < SGC‐7901 < BGC‐823 。

隨后作者利用基因芯片分析這些胃癌品系的miRNA 和mRNA 表達(dá)差異，希望能找到耐受性差異的分子機(jī)制。首先作者利用Agilent Human miRNA Microarray V2.0 分析這6 種人類胃癌細(xì)胞microRNA 的表達(dá)情況，找到了25 個(gè)microRNA，這些microRNA 的表達(dá)豐度與HCPT耐受性的強(qiáng)弱有關(guān)。然后利用Affymetrix HG‐U133+ PM Array Plate 分析mRNA 的表達(dá)情況，結(jié)果找到了307 個(gè)與HCPT 耐受能力相關(guān)的mRNA，其中33 個(gè)基因曾經(jīng)被報(bào)道與腫瘤形成、細(xì)胞增殖有關(guān)。

相關(guān)的基因芯片實(shí)驗(yàn)在生物芯片上海國家工程研究中心完成。

圖1：microRNA 芯片結(jié)果聚類圖。隨著耐受性的增強(qiáng)，13 個(gè)microRNA 表達(dá)量增強(qiáng)，12個(gè)microRNA 表達(dá)量降低。

圖2：表達(dá)譜芯片結(jié)果聚類圖。找到了307 個(gè)與HCPT 耐受能力相關(guān)的mRNA，其中33 個(gè)基因曾被報(bào)道與腫瘤形成、細(xì)胞增殖有關(guān)。

最后，作者對microRNA 芯片和表達(dá)譜芯片的結(jié)果進(jìn)行整合。用PicTar 和TargetScan 預(yù)測這25 種microRNA 作用的靶mRNA，結(jié)果發(fā)現(xiàn)這些預(yù)測得到的靶mRNA 與表達(dá)譜芯片篩選到的307 個(gè)基因有50 個(gè)基因重合。結(jié)果提示，胃癌細(xì)胞原發(fā)性抗藥性很有可能是由于microRNA 表達(dá)差異，調(diào)節(jié)了這50 個(gè)基因中的一些基因所導(dǎo)致的。

圖3： microRNA芯片篩選到差異表達(dá)的microRNA，用軟件預(yù)測這些microRNA的靶基因，與表達(dá)譜芯片得到的差異表達(dá)基因有50 個(gè)重合。

原文出處：
Wu XM, Shao XQ, Meng XX, Zhang XN, Zhu L, Liu SX, Lin J, Xiao HS. Genome‐wide analysis of microRNA and mRNA expression signatures in hydroxycamptothecin‐ esistant gastric cancer cells. Acta Pharmacol Sin. 2011, 32(2):259‐69. （影響因子1.783）

使用服務(wù)種類：Agilent Human miRNA Microarray / Affymetrix HG‐U133+PM Array Plate 芯片服務(wù)