種群內(nèi)和近緣種之間的表型差異，通常是由基因表達的變化和進化而驅(qū)動的。然而，大多數(shù)分析都集中在基因組變異對順式調(diào)節(jié)元件（如控制轉(zhuǎn)錄活性的啟動子和增強子）的影響，而對于轉(zhuǎn)錄后過程對轉(zhuǎn)錄本進化的影響，我們卻知之甚少。近期，來自美國芝加哥大學、霍華德休斯醫(yī)學研究所等處的研究人員，在國際基因組學權(quán)威期刊《Genome Research》發(fā)表的一項研究，對這個問題進行了探討。

本文通訊作者是芝加哥大學基因組學和系統(tǒng)生物學研究所的Kevin White教授，知名華人學者何川教授也是本文共同作者之一。何川教授主要從事化學生物學、核酸化學和生物學、遺傳學等方面的研究。近年來在甲基化修飾，尤其是5hmC和m6A等方面獲得了許多重要的發(fā)現(xiàn)。迄今已在Nature，Science等國際權(quán)威學術(shù)期刊發(fā)表了大量論文。曾榮獲美國癌癥研究青年科學家獎，凱克基金會醫(yī)學研究杰出青年學者獎等多個獎項，并當選為頂級生命醫(yī)學研究院HHMI研究員。

由調(diào)控變化所調(diào)節(jié)的基因表達差異，被認為是近緣種之間表型差異的一個主要貢獻者。大多數(shù)破譯基因表達進化基礎(chǔ)的研究，都集中在識別順式作用的基因組調(diào)控元件和反式作用調(diào)控元件——它們驅(qū)動著物種和種群之間的差異。在進化過程中，基因調(diào)控是否也在轉(zhuǎn)錄后水平上分化，它們可能會對基因表達產(chǎn)生什么樣的影響，在很大程度上還是未知的。

作為最普遍的轉(zhuǎn)錄后mRNA修飾，N6-甲基腺嘌呤（m6A）RNA轉(zhuǎn)錄修飾的生物化學和分子遺傳學已經(jīng)被得以廣泛研究，因為它在真核生物中是無處不在的，以及它的可逆性、對mRNA壽命和翻譯效率的影響，及其在生物學通路關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子和人類疾病中的調(diào)控作用。先前的研究還調(diào)查了m6A甲基化在人類和小鼠之間以及在擬南芥中的保守性。然而，幾乎沒有人知道這個重要的轉(zhuǎn)錄后修飾的進化或種群動態(tài)學。

在這項研究中，研究人員分析了來自人類、黑猩猩和恒河猴的淋巴母細胞系（LCLs）中的m6A mRNA修飾，并且他們確定了物種之間的m6A進化模式。研究人員發(fā)現(xiàn)，m6A進化是與共有RNA序列基序（已知與調(diào)節(jié)m6A動態(tài)的酶復(fù)合物相關(guān)）共同發(fā)生的，m6A修飾基因的表達進化，是與m6A進化共同發(fā)生的。