Nature Methods:如何提高基因組編輯的特異性
日期:2015-03-25 08:59:37
ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9是近年來最熱門的基因組編輯工具。這些核酸酶可以向基因組中引入位點特異性的雙鏈斷裂,然而利用寡核苷酸與目的位點的同源重組進行修復,最終實現對基因組特定位點的改變。
對細胞進行基因編輯有著巨大的應用潛力,但這些技術的安全性還令人憂慮。目前基因組編輯的效率還不夠高,脫靶效應大大限制了它們的應用范圍,尤其是在臨床方面。Nature Methods雜志發表的一項新研究解決了這個問題,大大提高了TALE核酸酶編輯基因組的特異性。
TALE蛋白的奇特之處在于它的DNA結合結構域。與其他DNA結合結構域不同,TALE蛋白的DNA 結合結構域由不同數量的重復單元組成,每一個重復單元特異識別一個DNA堿基對。大多數情況下每個重復單元由34個氨基酸組成,這34個氨基酸中除了第12、13位的氨基酸變化較大之外,其他氨基酸高度保守。這兩個不保守的氨基酸被命名為RVD(repeat variable diresidue),決定著TALE重復單元識別的核苷酸種類。
TALE蛋白的特異DNA序列識別以及靈活的可組裝性,使其在分子生物學領域有著巨大的應用前景。人們可以在此基礎上設計和組裝任意的TALE單元,去識別目標DNA序列。這一特性已經被用來構造能夠特異性切割DNA雙鏈的TALE核酸酶(TALEN),在細胞基因組中進行定點突變、定點敲除等操作。
TALE核酸酶的設計規則很簡單,不過這種簡單性也使人們難以進一步改善,提高它的活性和特異性。為了突破這樣的局限,Sangamo BioSciences公司的研究人員開發了一組拓展型RVD,并用這些RVD來改進TALE的性能。研究顯示,新型RVD能夠大大減少TALE核酸酶的脫靶效應。
這項研究為人們提供了新RVD及其設計策略,有助于開發更強大的TALE,進一步擴大這一技術在醫學和生物技術領域的應用范圍。
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